公元2017年9月9日12:00，在所有人都在正常地过着自己的生活的时候，一道超出常理的身影没有任何预兆的在全球所有电子设备上出现了，那是一个全身由黑色和绿色组成的蒙面骑士。没错，他就是《假面骑士Ex-aid》里的假面骑士Cronus。
他手里拿着一个散发着神圣光芒的卡带，其名为《假面骑士编年史》，突然出现的他犹如神明一般，给人类带来了末日的审判！
“人类啊，你们霸占这个真实世界的时代已经结束了，新的生命体Bugstar，将取代你们成为这个世界的主宰，想要活下去的话，就开始游戏吧，堵上种族命运和整个世界的游戏——《假面骑士编年史》！做出选择吧，人类！战斗亦或逃亡！”
宣言结束的同时，他手中的卡带启动了，一阵耀眼的白光闪过，整个地球上的人类除了12岁以下的儿童，所有人的手里都出现一个与假面骑士Cronus手中一模一样的《假面骑士编年史》的卡带。还没有等人们反应过来，大量的橘黄色球状怪物从电子设备中钻了出来，成千上万的怪物不断地在世界各地破坏着地球的文明，武器、建筑、网络、交通工具等所有的一切，在仅仅一天之内就遭到了毁灭性的破坏。
由于没有任何防备，人类几乎没有太强的反击能力，虽然怪物只注重于破坏文明，但还是有近五成的人类被卷入其中，死在了这场毁天灭地的破坏中。这一天被末世中的人类成为“起始之日”！
起始之日结束后，过亿的怪物凭空从世界上消失了，虽然怪物消失了，但人类依旧生活在恐惧之中。建筑被毁，人类失去了安身之所；网络、通信被毁，人们无法联系远方的亲人；交通、道路被毁，人们连过远的移动都做不到。只有政府机关还保留着一些健全的设施，尽管各国全力实行救援，但依旧有很多人在各种各样的问题中死去了。
几天过去了，有很多人都反应过来了，那个带来末日的骑士正是岛国特设剧《假面骑士Ex-aid》里的人物，假面骑士Cronus。但了解也没什么用，难道去把岛国人都杀了就可以改变现实吗？当然不可能。不过由于存活下来并且看过《假面骑士Ex-aid》这部剧的人，将出现在人们手中的《假面骑士编年史》的卡带的使用方法传播了出去，使得很多人都学会了使用卡带变身成Ride Player,这使剩余的人大幅度的提升了生存几率，这使人类看到了希望，在末世中应势建立的Ride Player的新文明开始崛起。
起始之日一个月之后，此时人类还剩3成左右，但由于编年史卡带的普遍的应用，使得人类的末日生活稳定下来，人类数量不再呈现骤减的趋势。而这一天12：00，一样的时间，假面骑士Cronus再次出现了。由于电子设备尽毁，这次他出现在天空中巨大的虚拟屏幕上，在无数人惊恐的目光中开始了新的发言。
“存活着的人类们，各位贵安！想必大家已经多少知道了我的身份，我乃最强的假面骑士，Cronus!虽然与你们人类所做的影视《假面骑士Ex-aid》的设定相似，但还是有本质上的区别的，请分清虚幻与现实。现在由我来讲解《假面骑士编年史》的游戏规则。”
“《假面骑士编年史》共分为十层关卡，等级分为Lv1~Lv99，以及超越正常等级的究极级别Lv100,也就是我的等级。从今天起你们这个残破的真实世界为游戏的新手层，正式的1~9层在游戏世界。从今天开始这里将会陆续出现Bugster连接体来提供给各位玩家刷怪升级，不过各位放心，新手层只有一些低级怪物，最高的boss也只有Lv10。玩家攻略完新手层的boss后，便可自由进入游戏世界挑战下一层。但不要以为只要到达Lv10，然后不去下一层就没有危险了，每一层的攻略是有时间限制的，时间一到，没有攻略完的高等级的boss，就会将战场转移到现实世界，所以想活下去，就要不断升级和攻略。”
“不过各位放心，我们《假面骑士编年史》与电视中的是不一样的，过程会非常公平，游戏中准备了充足的道具提供各位升级变强。并且12岁以下的儿童可暂时不必参加，Bugstar也不会主动攻击他们。当达成某种条件时，会由我们专门的裁判,游戏世界第6层的boss——Poppy Pipopapo为大家提供游戏帮助。”
Cronus说完，屏幕上出现了与电视中长得一模一样的人形Bugstar——Poppy Pipopapo！
Poppy Pipopapo一脸兴奋地向所有人类喊道：“大家好，我是本游戏的新手裁判Poppy Pipopapo，当大家有不解的疑问时，我一定会积极的帮助大家的，现在宣布，新手层boss为Bugstar Salty,等级Lv10，攻略限时为3个月，《假面骑士编年史》正式开始。”
随着少女的宣布，决定命运的末日游戏正式开始了。。。。。。